1、蔬菜水培配套设施一次性投资较大，特别是建玻璃大棚、连栋大棚，及供液排液配套设施，还有用电、肥料等，生产成本较高。因此，如何提高其经济效益是当前急待解决的问题。
  2、水培法因营养液循环流动，病菌传播速度快，如何利用物理技术和生物技术防治，尽量减少或不用农药，使产品成为无公害蔬菜，是当前水培中值得深入研究的问题。
  3、蔬菜水培中的营养液配制、消毒、供氧和病虫防治等要求较高的技术，而当前普遍存在管理技术跟不上的现象。因此，提高管理人员的技术水平，减少管理上的盲目性，也是有待解决的问题。

  第二、蔬菜水培的前景与展望

  1、操作简单、成本低廉的新模式的出现使水培蔬菜有望得到大面积推广，比如近研制的悬浮盆非循环水培法，在蔬菜整个生长期只需在初施用水、肥，无需电力和水泵，操作简单、成本低廉。
  2、水培能栽种出高产、优质和反季节蔬菜产品，还可以克服土壤栽培中的连续耕作灾害，减少病虫害，生产出无公害的绿色食品，应用前景更广，是生态农业的发展方向。
  3、应用水培可以在大型工矿区、海滩、沙漠、盐碱地、严重退化土壤地区等一些不宜农业耕作、无产低产地区和太空农业、海上及水下农业中发挥重要作用，不受地方限制。因此，蔬菜水培有着广阔的发展空间。