棚室蔬菜上的气传病害和小型害虫，如灰霉病、霜霉病、白粉病、蚜虫、蓟马、粉虱和红蜘蛛等，70%以上的初始来源是本棚室。蔬菜大棚建造专家指出当前，北方棚室蔬菜陆续进入春茬育苗和定植期，抓住有利时机开展棚室表面消毒，能够在源头上减轻病虫害，起到事半功倍的效果。
棚室表面消毒常用方法有三种：喷雾施药法、烟雾施药法和臭氧消毒法。
采用喷雾法消毒，优先选用广谱的杀虫剂和杀菌剂，杀菌剂可选250克/升吡唑醚菌酯乳油、60%唑醚·代森联水分散粒剂、250克/升嘧菌酯、10%苯醚甲环唑水分散粒剂、72%霜脲·锰锌可湿性粉剂等，杀虫剂可选兼治螨类的18克/升阿维菌素乳油、25克/升高效氯氟氰菊酯乳油、1.8%阿维·高氯乳油和4.8%甲维·高氯氟乳油等。此时距离蔬菜收获时间较长，可选择1～2种杀菌剂和一种杀虫剂混合使用。喷雾时应覆盖整个棚室内，施药人员应做好防护。
蔬菜大棚建造专家指出烟雾施药法需采用烟剂和熏蒸剂等特定剂型的药剂，或借助常温烟雾施药机和热烟雾机等专用器械施药。杀虫可选22%敌敌畏烟剂、3%高效氯氰菊酯烟剂、20%异丙威烟剂和12%哒螨·异丙威烟剂，杀菌可用15%腐霉·百菌清烟剂和12.5%甲霜·百菌清烟剂和电热硫磺蒸发器等；也可选用辣根素复合生物熏蒸剂，其为灭生性药剂，兼具杀虫杀螨和杀菌作用。喷雾法中所选药剂大多也适用于常温烟雾施药机和热烟雾机，而且机械施药穿透性性和均匀性好，有条件宜优先采用。
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